重庆市黔江区卫生局位于黔江区新华大道城西六路，2000年5月黔江区成立时由原黔江开发区卫生局和黔江县卫生局合并组建而成。内设局办公室、人事教育科、规划财务科、医政科、疾病预防控制科、民族基层卫生与妇幼保健科、中医科、卫生法制与监督科等8个职能科室。全区现有中心医院、区中医院、区民族医院、区疾病预防控制中心、区妇幼保健院、区卫生监督所、中心血站和27个乡镇卫生院、3个社区卫生服务中心、182个村卫生室，卫生人员1217人（其中卫生技术人员1070人）、乡村医生443人，每千人拥有卫生人员2.43人。设有病床600张。
    黔江新区建立以来，区卫生局紧紧围绕区委、区政府确定的构建渝东南医疗服务中心目标，以发展为主题、改革为动力、农村为重点、项目为载体，克难奋进，开拓创新，在卫生改革、基础设施建设、疾病预防控制和基层妇幼保健、卫生执法监督、医疗服务质量、行业作风建设等方面取得了明显进步，区直医疗卫生单位在周边辐射作用日渐凸显，乡、村卫生服务提供能力明显增强，区、乡、村三级医疗卫生网络服务体系日趋完善，医疗卫生服务综合水平得到提升。
 农村卫生改革成效显著。坚持用改革的办法解决农村卫生事业发展中的问题，2000年以来，以对乡镇卫生院院长竞聘制、任期目标管理责任制、年薪制“院长三制”管理改革为核心，全面推行全员聘用合同制，有序实施乡镇卫生院全成本核算制度、会计委派制度、卫生事业经费投入结构改革、乡镇卫生院职工合作经营试点改革、职工分配制度试点改革，建立了一套乡镇卫生院由区卫生局集中统一管理条件下的农村卫生工作运行机制，增强了乡镇卫生院的活力，激活了乡镇卫生院的发展，在农村卫生改革和乡镇卫生院管理方面走在了全市的前列，连年被评为重庆市目标管理优秀单位。
 基础设施建设步伐加快。整合卫生资源，加大对中心医院的投入，新建8000平方米的门急诊楼，购进CT等先进设备，传染病医院开工建设，力争2008年前在二级乙等综合医院的基础上建成三级甲等综合性医院；区中医院和区妇幼保健院正在积极创建二级甲等中医院和市级示范保健院；由国债项目支持的区疾病预防控制中心检测楼竣工投入使用；区中心血站于2004年3月19日通过市上验收并正式投入运行，规范了一区三县的制、贮、采、供血。按照《黔江区乡镇卫生院建设规划》，已完成了一批乡镇卫生院业务用房、辅助用房、院内环境、职工宿舍配套建设；村卫生室建设正按《黔江区村卫生室建设规划》逐步实施。
 疾病预防控制和卫生执法能力明显增强。依托卫生项目大力实施突发公共卫生事件医疗救治、预防控制、信息网络体系建设，率先在全市实现传染病疫情监测网络直报。区疾控中心实验室、艾滋病初筛实验室投入使用，卫生检测和疾病监测能力大大增强。 全区“四苗”全程接种率、孕产妇系统管理率、孕产妇住院分娩率稳步上升，孕产妇死亡率、婴儿死亡率逐年下降。切实贯彻《行政许可法》，加强医疗市场监管，有效开展日常卫生监督监测工作、食品药品放心工程、学校周边环境整治、重大节日食品安全检查等突击监督监测工作，进一步规范执法行为，加大了执法力度，依法行政能力明显增强。
 医疗服务质量和服务态度大改善。通过深入开展医疗质量年活动，强力推行临床诊疗规范、院内感染控制规范和基本药物目录制度，贯彻执行新的医疗服务收费标准，严格执行药品集中招标采购制度，村卫生室药品由乡镇卫生院统一代购，狠抓行业作风建设，严肃查处医疗服务和医药购销中收受 “回扣”、“红包”等不正之风，推行向社会公开服务承诺制度、院务公开制度、医疗服务和药品价格公示制度，促进了医疗机构经济效益和社会效益的同步增长。
 卫生Ⅷ及其支持性项目工作进展良好。通过积极实施卫Ⅷ及其支持性项目，在加快农村卫生改革、强化乡镇卫生院管理、改善基本医疗服务等方面取得了有推广价值的经验，得到了世界银行、英国国际发展部和中央项目办的好评，自1999年开始实施以来，连年获得全市一等奖。国债疾控中心项目建成，为重庆市救灾防病应急处理中心黔江分中心的启动奠定了基础；卫Ⅹ（结核病控制）项目、母婴平安—120项目顺利推进；2003年6月黔江区被确定为重庆市新型农村合作医疗6个试点区县之一，2003年9月正式启动，试点工作扎实推进， 在合作医疗基金管理、方案设计、供方行为规范等方面取得了经验。